Периодически создавать резервные копии своих данных не является паранойей... Это нормально. Кроме этого... 1 раз создав копию настроек своих программ Вы сможете безболезненно мигрировать с одного компа на другой. Согласитесь удобно!

Предположим, для Вас важны:
.filezilla - профили вашего FTP клиента;
.gaim - профили IM и логи общения;
.mozilla-thunderbird - настройки почты;
.purple - профили IM и логи общения;
.thunderbird - сама почта;
.liferea_1.4 - настройки и фиды rss читалки;
.Skype - профиль Skype;
.tomboy - заметки созданные в tomboy.

Читать статью полностью